More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0506 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
859 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
860 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
860 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
864 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1229  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
864 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
824 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
868 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0232  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
890 aa  675    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0171  leucyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
874 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
887 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0060  leucyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
838 aa  917    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2744  leucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
877 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.775327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2498  leucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
847 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637168  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
863 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3135  leucyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
873 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0558911  hitchhiker  0.00000682478 
 
 
-
 
NC_004310  BR1807  leucyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
877 aa  767    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1740  leucyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
894 aa  768    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.723566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
868 aa  708    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
829 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3415  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
864 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0104  leucyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
875 aa  726    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
864 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
823 aa  673    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
823 aa  672    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
868 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
921 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
876 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
862 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
862 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2834  leucyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
873 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0282  leucyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
829 aa  891    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
857 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0091  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
883 aa  754    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
872 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
913 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
819 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 
868 aa  693    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0840  leucyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
847 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
851 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3740  leucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
864 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
884 aa  684    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
875 aa  689    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
824 aa  658    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
829 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
877 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3786  leucyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
888 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
825 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
856 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
865 aa  720    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  41 
 
 
866 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
862 aa  839    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
829 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1211  leucyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
882 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0370  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
864 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0385  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
874 aa  748    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.039423  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
848 aa  803    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0506  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
851 aa  1769    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00566899  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0794  leucyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
829 aa  897    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0411  leucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
863 aa  726    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0758  leucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
892 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
824 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
882 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
817 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
824 aa  648    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
863 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
906 aa  689    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0436  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
878 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
856 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
878 aa  756    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
934 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2973  leucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
873 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
856 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3450  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
864 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
864 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0045  leucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
857 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.269909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3020  leucyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
849 aa  770    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.336439  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0171  leucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
864 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
856 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
870 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
871 aa  762    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
864 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
878 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
827 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
929 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2050  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
864 aa  781    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2852  leucyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
835 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.206237  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
864 aa  721    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1176  leucyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
894 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
824 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
865 aa  767    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0549  leucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
864 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
873 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0218  leucyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
897 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0654  leucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
864 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
829 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
859 aa  721    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
859 aa  666    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
817 aa  703    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2640  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
864 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
823 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>