More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2524 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  100 
 
 
321 aa  662  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  83.96 
 
 
320 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  83.65 
 
 
320 aa  562  1e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  81.68 
 
 
324 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 
301 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 
301 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  75.34 
 
 
301 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  74.25 
 
 
303 aa  470  1e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  74.25 
 
 
303 aa  470  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  74.66 
 
 
301 aa  470  1e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  74.25 
 
 
303 aa  470  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  464  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  464  1e-130  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  464  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  73.09 
 
 
301 aa  466  1e-130  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  72.76 
 
 
301 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  71.76 
 
 
301 aa  459  1e-128  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  72.09 
 
 
302 aa  461  1e-128  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  72.54 
 
 
300 aa  453  1e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  65.1 
 
 
300 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  65.41 
 
 
332 aa  416  1e-115  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  66.56 
 
 
300 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  65.23 
 
 
305 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  68.01 
 
 
314 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  65.88 
 
 
331 aa  405  1e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  63.12 
 
 
338 aa  407  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  62.19 
 
 
338 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  62.19 
 
 
338 aa  404  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  62.19 
 
 
338 aa  404  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  62.19 
 
 
338 aa  404  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  61.42 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  65.35 
 
 
339 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  65.02 
 
 
339 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  65.02 
 
 
339 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  65.02 
 
 
339 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  64.55 
 
 
330 aa  400  1e-110  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  61.83 
 
 
329 aa  400  1e-110  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.78109e-06  unclonable  1.43866e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  62.58 
 
 
334 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  62.99 
 
 
335 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  58.25 
 
 
299 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 
300 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  58.98 
 
 
299 aa  355  4e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  58.36 
 
 
305 aa  355  4e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  57.68 
 
 
302 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  56.52 
 
 
298 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  57.63 
 
 
300 aa  348  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0280  GTP-binding protein Era  55.18 
 
 
301 aa  345  6e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  56.71 
 
 
302 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  56.66 
 
 
300 aa  342  3e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  57.34 
 
 
300 aa  343  3e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  57.34 
 
 
300 aa  343  3e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  57.34 
 
 
300 aa  343  3e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3950  GTP-binding protein Era  56.66 
 
 
300 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  56.38 
 
 
300 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  55.97 
 
 
305 aa  341  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  50.99 
 
 
314 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  51.36 
 
 
311 aa  339  3e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  52.33 
 
 
306 aa  338  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  51.02 
 
 
311 aa  337  1e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  51.7 
 
 
315 aa  327  2e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  51.37 
 
 
295 aa  317  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
295 aa  312  5e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  50.31 
 
 
330 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  50.66 
 
 
321 aa  310  3e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  50 
 
 
338 aa  308  7e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
298 aa  308  9e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  50.31 
 
 
339 aa  307  1e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
309 aa  304  1e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 
293 aa  303  3e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
299 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
299 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
299 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
312 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
299 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  49.04 
 
 
311 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
299 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
312 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
312 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 
305 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
294 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  49.49 
 
 
297 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
348 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
299 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  49.65 
 
 
287 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  49.65 
 
 
287 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
311 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>