67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0739 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  84.01 
 
 		 519 aa  885    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  100 
 
 		 519 aa  1030    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  64.02 
 
 		 515 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  84.01 
 
 		 519 aa  883    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  82.85 
 
 		 519 aa  873    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  60.94 
 
 		 520 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  60.76 
 
 		 518 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  59.88 
 
 		 512 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  58.25 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  55.25 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  55.06 
 
 		 519 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  55.12 
 
 		 519 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  55.06 
 
 		 519 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  54.28 
 
 		 519 aa  555  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  46.41 
 
 		 520 aa  499  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  48.64 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  48.25 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  43.33 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  47.47 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  42.99 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  42.32 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  44.02 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  43.55 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  42.67 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  42.99 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  44.3 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  42.99 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  42.61 
 
 		 528 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  42.88 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  42.67 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  43.71 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  42.38 
 
 		 535 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  42.3 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  42.49 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  43.44 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  43.39 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  43.39 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  43.37 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  42.48 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  43.19 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  43.02 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  42.88 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  42.83 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  39.53 
 
 		 511 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  36.79 
 
 		 512 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  36.79 
 
 		 512 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  34.76 
 
 		 514 aa  333  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  38.48 
 
 		 506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.24 
 
 		 507 aa  316  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  33.4 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  36.44 
 
 		 505 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  35.71 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.91 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.91 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.91 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.91 
 
 		 510 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  34.7 
 
 		 508 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  34.22 
 
 		 585 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.7 
 
 		 508 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  34.7 
 
 		 508 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  34.7 
 
 		 508 aa  293  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  33.39 
 
 		 552 aa  273  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  35.49 
 
 		 305 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  32.88 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  21.41 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.67 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.31 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>