15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0017 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1234  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  48.07 
 
 
540 aa  138  3e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  29.44 
 
 
2062 aa  79.3  2e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  29.1 
 
 
529 aa  60.8  7e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  29.1 
 
 
529 aa  60.8  7e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  28.77 
 
 
465 aa  59.3  2e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  29.63 
 
 
527 aa  58.9  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  24.52 
 
 
1027 aa  51.6  4e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  25.81 
 
 
565 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  24.79 
 
 
599 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  25.66 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  24.57 
 
 
407 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  26.81 
 
 
390 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  26.02 
 
 
518 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  24 
 
 
602 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>