25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2733 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  100 
 
 
106 aa  213  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  70.75 
 
 
107 aa  155  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  66.98 
 
 
106 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  66 
 
 
106 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  56.7 
 
 
107 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 
105 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  53.76 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  50.51 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  50.51 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  51 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  49.51 
 
 
106 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  45.45 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  46 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  43.3 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 
103 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0600  hypothetical protein  56.82 
 
 
137 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236988  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  37.7 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  34.62 
 
 
106 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  29.79 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  30.53 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>