76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0276 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  100 
 
 
100 aa  202  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  67 
 
 
103 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  69.15 
 
 
104 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  67.35 
 
 
107 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  67.35 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  66.33 
 
 
104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  63.27 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3123  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2079  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3002  addiction module antidote protein  43.62 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  67.35 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3155  putative transcriptional regulator  39 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239561  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0494  hypothetical protein  58 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  44.87 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0368  addiction module antidote protein  50.63 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  50.82 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  50.82 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2621  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1150  hypothetical protein  42.39 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5375  hypothetical protein  30.69 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00339875  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  38.04 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3926  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.511666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  36.56 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1686  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
98 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0829  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00761962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 
97 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0898  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368951  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6941  putative transcriptional regulator  31 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0856  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.623315 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0184  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.57004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0051  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4548  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  31.91 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9109  hypothetical protein  38.16 
 
 
286 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2280  transcriptional regulator-like  37.84 
 
 
305 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  0.372156 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0174  putative addiction module antidote protein  32.43 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3348  putative transcriptional regulator  51.35 
 
 
40 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767787  normal  0.423432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1577  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  29.79 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  31.76 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  32.18 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0573  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6313  addiction module antidote protein  32.43 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0276744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05545  hypothetical protein  31.25 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1983  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40590  transcriptional regulator protein  32 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4952  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0141  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389686  hitchhiker  0.00339535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4018  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3672  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.932392  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0861  transcriptional regulator  35.62 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1295  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.053916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5507  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366583  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6535  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2207  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0040  addiction module antidote protein  30.12 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2007  transcriptional regulator  29.07 
 
 
102 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 
95 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0366  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2314  putative transcriptional regulator  30 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3780  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
99 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.798445  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3743  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
99 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.643331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3989  hypothetical protein  29.76 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>