More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2767 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2767  ATPase  100 
 
 
311 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.74 
 
 
315 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  46.07 
 
 
278 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  45.7 
 
 
292 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  46.4 
 
 
277 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  46.59 
 
 
297 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  49.6 
 
 
283 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  49.21 
 
 
278 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  46.92 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  48.81 
 
 
284 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  48.22 
 
 
284 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  46.43 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  47.43 
 
 
284 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  47.56 
 
 
279 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  47.56 
 
 
279 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  44.09 
 
 
279 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  48.8 
 
 
280 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  47.6 
 
 
284 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  45.45 
 
 
293 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  46.54 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  45.42 
 
 
290 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  46.8 
 
 
285 aa  215  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  46.15 
 
 
301 aa  215  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  47.04 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  46.34 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  48.03 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  46.85 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  46.46 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  46.64 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  44.67 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  47.6 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  46.1 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  46.85 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  46.46 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  49.6 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  46.85 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  46.21 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  46.46 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  46.85 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  44.96 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  46.46 
 
 
281 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  49.2 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  45.35 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  47.76 
 
 
284 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  47.2 
 
 
281 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  45.25 
 
 
345 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  45.45 
 
 
284 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  46.46 
 
 
281 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  46.25 
 
 
280 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.85 
 
 
280 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  46.48 
 
 
281 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  47.11 
 
 
294 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  47.6 
 
 
283 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.6 
 
 
283 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  45.35 
 
 
289 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  47.54 
 
 
286 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  47.54 
 
 
286 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  47.54 
 
 
286 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.52 
 
 
280 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.8 
 
 
283 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  45.93 
 
 
286 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  47.54 
 
 
280 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  47.54 
 
 
280 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  46.69 
 
 
280 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  44.66 
 
 
280 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  46 
 
 
283 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  46.69 
 
 
280 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  45.6 
 
 
281 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  46.8 
 
 
281 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  47.52 
 
 
280 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  47.52 
 
 
280 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  42.7 
 
 
335 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  48.35 
 
 
280 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  46.31 
 
 
280 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.67 
 
 
282 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.2 
 
 
281 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  46.31 
 
 
280 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  46.31 
 
 
280 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.67 
 
 
282 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  46.31 
 
 
280 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  46.31 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  48.91 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  46.31 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  46.31 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  47.93 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  47.52 
 
 
280 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  47.11 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  40.48 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  42.25 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  46.75 
 
 
281 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  46.28 
 
 
281 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.11 
 
 
280 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  47.93 
 
 
281 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  38.85 
 
 
279 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  39.78 
 
 
280 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  39.15 
 
 
308 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.25 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2229  ATPase  44 
 
 
381 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2133  ATPase-like protein  38.63 
 
 
315 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170548  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4307  ATPase  40 
 
 
364 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0507222  normal  0.12716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>