More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3520 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  100 
 
 
351 aa  700    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  56.7 
 
 
358 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  54.55 
 
 
358 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  56.36 
 
 
350 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  56.36 
 
 
350 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  56.36 
 
 
350 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  54.31 
 
 
356 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  53.24 
 
 
345 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  49.86 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  50.43 
 
 
347 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  51.86 
 
 
346 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  51.86 
 
 
346 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  51.75 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.73 
 
 
339 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  51.23 
 
 
366 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  51 
 
 
353 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  48.58 
 
 
354 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  50 
 
 
341 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.14 
 
 
346 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3851  ferredoxin  49.31 
 
 
360 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  52.04 
 
 
355 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  41.44 
 
 
361 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  46.49 
 
 
340 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  45.45 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  40.69 
 
 
346 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  39.66 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  39.47 
 
 
339 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  39.47 
 
 
339 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  39.47 
 
 
339 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.14 
 
 
341 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.94 
 
 
329 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  39.53 
 
 
339 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.91 
 
 
389 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.86 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  31.32 
 
 
357 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.01 
 
 
362 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.01 
 
 
362 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.75 
 
 
362 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.43 
 
 
358 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3372  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.87 
 
 
369 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.01 
 
 
362 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
362 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.01 
 
 
362 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
362 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
362 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
362 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  36.19 
 
 
362 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.06 
 
 
358 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.01 
 
 
362 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.92 
 
 
360 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  37.71 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.36 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.89 
 
 
364 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.44 
 
 
362 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.89 
 
 
364 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.08 
 
 
362 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.88 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  35.81 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.17 
 
 
365 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.47 
 
 
358 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.23 
 
 
358 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  35.18 
 
 
361 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  37.06 
 
 
358 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.53 
 
 
362 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.3 
 
 
349 aa  186  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.81 
 
 
362 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.53 
 
 
362 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.53 
 
 
362 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.25 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.25 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.25 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.16 
 
 
362 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.06 
 
 
367 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3822  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.22 
 
 
356 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal  0.275552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.79 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.85 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.9 
 
 
365 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  35.05 
 
 
337 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.51 
 
 
358 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.72 
 
 
352 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.66 
 
 
368 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.13 
 
 
356 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  34.92 
 
 
356 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  33.52 
 
 
361 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  30.92 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.08 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  33.52 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.33 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.08 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.34 
 
 
358 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  33.42 
 
 
366 aa  172  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.24 
 
 
356 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.83 
 
 
360 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.24 
 
 
356 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3949  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.73 
 
 
361 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.97 
 
 
356 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1231  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.51 
 
 
364 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.06 
 
 
358 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1242  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  33.7 
 
 
366 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  33.24 
 
 
350 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>