20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0398 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  31.44 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  34.95 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  31.05 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  29.73 
 
 
231 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  32.02 
 
 
524 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  29.02 
 
 
247 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  32.98 
 
 
751 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  27.72 
 
 
256 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  27.72 
 
 
246 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  33.08 
 
 
856 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0180  hypothetical protein  46.03 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.1 
 
 
513 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  28.76 
 
 
205 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2160  hypothetical protein  51.52 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  31.3 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  28.88 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4406  hypothetical protein  29.73 
 
 
430 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.334284  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  25.9 
 
 
227 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>