57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2851 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2851  peptidase M55 D-aminopeptidase  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0564974  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8120  D-aminopeptidase  80.36 
 
 
280 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4003  peptidase M55 D-aminopeptidase  43.06 
 
 
279 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0365991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5860  peptidase M55 D-aminopeptidase  45.1 
 
 
283 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5273  D-aminopeptidase  45.45 
 
 
281 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19920  D-aminopeptidase DppA  37.32 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000508019  decreased coverage  0.0000487782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2747  peptidase M55 D-aminopeptidase  38.82 
 
 
282 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1594  peptidase M55 D-aminopeptidase  36.19 
 
 
271 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3210  peptidase M55 D-aminopeptidase  40 
 
 
277 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0351  peptidase M55 D-aminopeptidase  38.43 
 
 
273 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1020  peptidase M55 D-aminopeptidase  42.07 
 
 
279 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0142  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.93 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0164001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1265  D-aminopeptidase DppA  40.96 
 
 
271 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00495776  hitchhiker  0.000000282701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3975  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.93 
 
 
273 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0312  peptidase M55 D-aminopeptidase  37.7 
 
 
271 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2925  peptidase M55 D-aminopeptidase  37.69 
 
 
274 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4113  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.56 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.951094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4402  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.19 
 
 
273 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1662  D-aminopeptidase DppA  39.76 
 
 
272 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3107  peptidase M55, D-aminopeptidase  38.84 
 
 
272 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1922  D-aminopeptidase DppA  34.7 
 
 
272 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7323  hypothetical protein  36.8 
 
 
272 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0629  peptidase M55 D-aminopeptidase  36.78 
 
 
272 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0135  D-aminopeptidase DppA  37.19 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4322  peptidase M55 D-aminopeptidase  39.52 
 
 
280 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3467  peptidase M55 D-aminopeptidase  37.5 
 
 
275 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3349  peptidase M55 D-aminopeptidase  39.76 
 
 
275 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0275369  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3239  peptidase M55 D-aminopeptidase  34.56 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4167  peptidase M55, D-aminopeptidase  37.09 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4199  peptidase M55, D-aminopeptidase  37.09 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4221  peptidase M55 D-aminopeptidase  37.4 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436913  normal  0.615325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1863  D-aminopeptidase DppA  38.15 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1412  D-aminopeptidase DppA  35.4 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3575  peptidase M55, D-aminopeptidase  38.96 
 
 
275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00281601  normal  0.133258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0706  peptidase M55, D-aminopeptidase  38.16 
 
 
288 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4595  peptidase M55, D-aminopeptidase  32.96 
 
 
273 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4056  peptidase M55 D-aminopeptidase  40.67 
 
 
275 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3007  peptidase M55 D-aminopeptidase  31.97 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1743  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.48 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0783265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1323  peptidase M55 D-aminopeptidase  32.59 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.035577  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1848  peptidase M55, D-aminopeptidase  38.21 
 
 
285 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234321  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1384  hypothetical protein  32.71 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.803903  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0320  peptidase  38.28 
 
 
275 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0979  putative dipeptide transport protein  38.28 
 
 
275 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0397  putative dipeptide transport protein  38.28 
 
 
275 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.583711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0243  putative dipeptide transport protein  38.28 
 
 
276 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.997125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1763  putative dipeptide transport protein  38.28 
 
 
276 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1353  putative dipeptide transport protein  38.28 
 
 
276 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4422  peptidase M55 D-aminopeptidase  37.35 
 
 
275 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1257  peptidase M55 D-aminopeptidase  31.6 
 
 
271 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1929  peptidase M55, D-aminopeptidase  30.26 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0142981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1117  dipeptide transport protein, putative  39.2 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.350409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0500  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.49 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0840  D-aminopeptidase DppA  41.98 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181532  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3126  peptidase M55 D-aminopeptidase  41.98 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1790  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.57 
 
 
278 aa  109  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0534  D-aminopeptidase-like protein  27.34 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>