More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1200 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  100 
 
 		 305 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  59.73 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  64.52 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  58.11 
 
 		 310 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  49.15 
 
 		 296 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  54.18 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  49.5 
 
 		 331 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  49.08 
 
 		 333 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  48.15 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  43.05 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  44.01 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  44.36 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  46.13 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  47.5 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  44.98 
 
 		 271 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  43.64 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  41.87 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  38.03 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  41.95 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  40.15 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40.85 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  40.15 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  40.15 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  40.88 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  41.84 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  38.95 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  42.23 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  39.21 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  38.17 
 
 		 271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  26.15 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  29.24 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  29.24 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  30.08 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  28.4 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.02 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.02 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.02 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.02 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.02 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  28.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  28.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.91 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.91 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  27.69 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.91 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  27.38 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  23.33 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  26.95 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  29 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  30.48 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  29.96 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  28.9 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  29.34 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  29.77 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  29.12 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2530  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  30.4 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  29.39 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  28.95 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  28.17 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  25.65 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  29.81 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4371  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  29.1 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  26.74 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  29.89 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  29.5 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  30.69 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  30.8 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.72 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  29 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4255  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  26.17 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  24.92 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  28.06 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.31 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  26.54 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  26.54 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  26.54 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.54 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  26.54 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.54 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.54 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  31.12 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  24.04 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  27.41 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>