41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0572 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  100 
 
 		 312 aa  617  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  52.85 
 
 		 349 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  46.3 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  46.67 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  38.73 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  33.94 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.65 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  36.34 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.59 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.85 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  36.31 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.06 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  34.38 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  34.38 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  34.38 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  34.38 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  34.38 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  34.06 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  34.06 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.85 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.25 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  37.26 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  35.42 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.12 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  28.7 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.08 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  30.23 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.14 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  30.64 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  29.35 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.82 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  29.37 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 551 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.19 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.92 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.15 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  32.61 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.32 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  31.45 
 
 		 615 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>