35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11879 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  70.09 
 
 		 214 aa  297  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  67.5 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  68.69 
 
 		 214 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  67 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  67 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  58.17 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  40 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  42.47 
 
 		 244 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  37.04 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  39.56 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  42.41 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  42.73 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  34.5 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  33.94 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  38.62 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  42.42 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  31.92 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  28.32 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  41.24 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  38.13 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  27.71 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06573  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182291  normal  0.0690952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  26.52 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  26.2 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  29.28 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  28.7 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  34.29 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  30.63 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  30.17 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.48 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  33.03 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  30.56 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  29.95 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>