More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1606 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
496 aa  955  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0760  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  89.75 
 
 
496 aa  786  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.29344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  57.99 
 
 
506 aa  516  1e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0609  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.43 
 
 
496 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1619  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  58.38 
 
 
494 aa  492  1e-138  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0249926  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  58.38 
 
 
494 aa  493  1e-138  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1375  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  57.32 
 
 
494 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1867  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  58.51 
 
 
493 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4474  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  58.33 
 
 
500 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220844  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.89 
 
 
503 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4249  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  51.72 
 
 
523 aa  453  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4311  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  51.72 
 
 
523 aa  453  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0412601  hitchhiker  0.0081583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1099  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  50.72 
 
 
496 aa  448  1e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4860  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.22 
 
 
513 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0748  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  49.8 
 
 
500 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00127358  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4080  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  51.02 
 
 
498 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  45.07 
 
 
504 aa  342  8e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1439  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  43.97 
 
 
533 aa  339  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  44.17 
 
 
511 aa  338  9e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  39.18 
 
 
534 aa  338  1e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.91 
 
 
523 aa  337  3e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2092  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.49 
 
 
513 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.93 
 
 
524 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.96 
 
 
524 aa  332  7e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.31 
 
 
537 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18571  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  42.01 
 
 
523 aa  327  2e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.960985 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  42.54 
 
 
512 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.926621  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.19 
 
 
512 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  42.76 
 
 
513 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06201  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  42.98 
 
 
513 aa  322  1e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2401  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39.39 
 
 
533 aa  321  2e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  39 
 
 
563 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.88 
 
 
532 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63526e-09 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1516  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.18 
 
 
538 aa  314  3e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2308  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.38 
 
 
561 aa  313  4e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  36.64 
 
 
524 aa  313  5e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02221  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.57 
 
 
538 aa  313  6e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.74 
 
 
497 aa  313  6e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.77 
 
 
525 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.09 
 
 
545 aa  310  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01671  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.4 
 
 
534 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  35.26 
 
 
537 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.3 
 
 
545 aa  310  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.43 
 
 
545 aa  308  1e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01691  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.2 
 
 
531 aa  308  2e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588128  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0152  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.4 
 
 
534 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.59 
 
 
545 aa  305  1e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.74 
 
 
507 aa  304  2e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.64 
 
 
544 aa  304  3e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0659  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  35.47 
 
 
527 aa  304  3e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.79601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  45.2 
 
 
561 aa  303  3e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4388  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  35.25 
 
 
526 aa  303  4e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.22 
 
 
545 aa  303  4e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.511316  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4450  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  35.25 
 
 
526 aa  303  4e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.487224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1976  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.82 
 
 
534 aa  303  5e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.304394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.62 
 
 
509 aa  303  5e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01651  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  38.63 
 
 
558 aa  303  6e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0292  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  40.53 
 
 
548 aa  303  6e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.58 
 
 
544 aa  303  7e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.45 
 
 
497 aa  301  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5216  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.84 
 
 
531 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1288  F420H2 dehydrogenase subunit M  38.07 
 
 
495 aa  299  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  8.9529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.65 
 
 
521 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  37.25 
 
 
515 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  36.85 
 
 
501 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  37.9 
 
 
504 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  40.09 
 
 
494 aa  297  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4656  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  41.11 
 
 
561 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000336952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.08 
 
 
560 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.08 
 
 
560 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  36.63 
 
 
513 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 
503 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.04 
 
 
495 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  37.6 
 
 
491 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.42 
 
 
549 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.62 
 
 
549 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  36.6 
 
 
489 aa  293  6e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26711  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  37.65 
 
 
563 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  36.65 
 
 
497 aa  292  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.79 
 
 
502 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  37.16 
 
 
522 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  37.6 
 
 
513 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
503 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.5 
 
 
535 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  36.45 
 
 
497 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.5 
 
 
506 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1280  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.62 
 
 
554 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  36.25 
 
 
488 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38 
 
 
506 aa  290  5e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4908  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.46 
 
 
559 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
509 aa  290  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  36.97 
 
 
502 aa  289  7e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>