29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0998 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  61.7 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  39.04 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  39.84 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  39.06 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  34.85 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  34.85 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  31.82 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  32.58 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  31.11 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  31.11 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  33.61 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  29.93 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  31.58 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.19 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.68 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  31.21 
 
 
148 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  30 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 
142 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 
137 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  29.31 
 
 
155 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  41.54 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>