47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0415 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  100 
 
 		 69 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  69.12 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  60.94 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  53.12 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  55.22 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  46.27 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  48.15 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  56.82 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  62.79 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  50.98 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  64.71 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  36.23 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.86 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.44 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  47.17 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.17 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.51 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  53.66 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  39.62 
 
 		 56 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  40 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  43.18 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  47.37 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  47.37 
 
 		 50 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  47.37 
 
 		 50 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  35.38 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  44.74 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  42.11 
 
 		 50 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  35.42 
 
 		 50 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  35.42 
 
 		 50 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  35.42 
 
 		 50 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  43.59 
 
 		 50 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  41.67 
 
 		 50 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  47.5 
 
 		 47 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  47.5 
 
 		 47 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  35.42 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  42.11 
 
 		 59 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  42.59 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  47.5 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  46.51 
 
 		 45 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  55.17 
 
 		 71 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  50 
 
 		 47 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  51.16 
 
 		 51 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  47.5 
 
 		 47 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  50 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  40 
 
 		 46 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  42.86 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>