More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4064 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  74.03 
 
 		 474 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  73.49 
 
 		 474 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  67.75 
 
 		 475 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  74.2 
 
 		 474 aa  746    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  81.63 
 
 		 476 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  73.9 
 
 		 474 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  72.92 
 
 		 475 aa  726    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  73.49 
 
 		 474 aa  758    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 473 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  73.9 
 
 		 474 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 		 474 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 		 474 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 		 474 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 		 473 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  75.76 
 
 		 474 aa  743    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  995    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  68.27 
 
 		 479 aa  685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  54.76 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  53.26 
 
 		 476 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  53.26 
 
 		 476 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  53.85 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 476 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  51.83 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  52.16 
 
 		 476 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  51.18 
 
 		 480 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.11 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 		 475 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  51.07 
 
 		 476 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  55.05 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.44 
 
 		 475 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 		 485 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 472 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  54.37 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  51.95 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  48.7 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  47.84 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  47.84 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  47.84 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  47.66 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  47.45 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  47.37 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  46.1 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 510 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  45.77 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  44.59 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  45.58 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  46.32 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  45.67 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  44.16 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  44.77 
 
 		 483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  42.11 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  42.61 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 		 484 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  44.03 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  43.82 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  42.11 
 
 		 469 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 		 481 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  43.15 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  41.77 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  42.4 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  41.9 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 		 472 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 477 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  42.08 
 
 		 477 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1067  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0951  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.83 
 
 		 468 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>