25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3828 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 482 aa  990    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  66.46 
 
 		 484 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  39.71 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  39.54 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  39.54 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  31.38 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  30.18 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  30.63 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  29.9 
 
 		 508 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  32.48 
 
 		 508 aa  213  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  32.48 
 
 		 508 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  25.24 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2314  hypothetical protein  25.81 
 
 		 297 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.643915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  27.78 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  27.01 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  29.73 
 
 		 135 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  30.46 
 
 		 195 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  29.05 
 
 		 195 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  26.62 
 
 		 187 aa  54.7  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  30.93 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  27.27 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  27.27 
 
 		 208 aa  50.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  30.51 
 
 		 215 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  36.99 
 
 		 150 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>