251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2308 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  76.31 
 
 
396 aa  656  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  1.19915e-09 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  75.56 
 
 
396 aa  650  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  77.31 
 
 
396 aa  664  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  82.54 
 
 
397 aa  702  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  76.31 
 
 
396 aa  654  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  76.56 
 
 
396 aa  654  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.66266e-05  unclonable  9.97439e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  76.31 
 
 
396 aa  652  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  87.28 
 
 
401 aa  747  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  2.91416e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  76.56 
 
 
396 aa  654  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  76.56 
 
 
396 aa  658  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  2.91193e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  81.55 
 
 
396 aa  696  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
401 aa  835  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  2.47869e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  77.06 
 
 
396 aa  658  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  76.81 
 
 
396 aa  659  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  76.31 
 
 
396 aa  652  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  3.61956e-12 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  71.57 
 
 
396 aa  603  1e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  68.83 
 
 
396 aa  582  1e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
397 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
398 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  417  1e-115  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  417  1e-115  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  48.63 
 
 
396 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.17501e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  48.38 
 
 
397 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  49.88 
 
 
396 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  48.63 
 
 
396 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  48.63 
 
 
396 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  48.13 
 
 
396 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  49.38 
 
 
398 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  48.13 
 
 
397 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  48.63 
 
 
401 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  48.38 
 
 
397 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
396 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  48.38 
 
 
396 aa  408  1e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  47.63 
 
 
396 aa  408  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  48.38 
 
 
396 aa  406  1e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  48.88 
 
 
396 aa  405  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  47.38 
 
 
397 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  2.01349e-06 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  46.63 
 
 
396 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  47.13 
 
 
396 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  47.38 
 
 
397 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  47.38 
 
 
397 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  47.88 
 
 
399 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  46.13 
 
 
397 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  46.63 
 
 
397 aa  400  1e-110  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  47.13 
 
 
397 aa  399  1e-110  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.24444e-05  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
396 aa  400  1e-110  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  47.63 
 
 
397 aa  401  1e-110  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  47.13 
 
 
397 aa  398  1e-110  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.56913e-06  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  48.38 
 
 
397 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  47.38 
 
 
397 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  46.38 
 
 
399 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  46.88 
 
 
397 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
397 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  1.97761e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  46.88 
 
 
397 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  45.39 
 
 
396 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  46.63 
 
 
396 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  46.38 
 
 
411 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0407  aromatic amino acid aminotransferase  44.89 
 
 
396 aa  388  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.761548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  46.63 
 
 
398 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  47.37 
 
 
398 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  46.37 
 
 
399 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  46.12 
 
 
399 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  44.75 
 
 
398 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  43.5 
 
 
394 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  45.11 
 
 
397 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 
395 aa  362  7e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  43.64 
 
 
398 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  4.15206e-13  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  43.39 
 
 
402 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  43.14 
 
 
398 aa  354  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  42.54 
 
 
401 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  42.25 
 
 
394 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  42.64 
 
 
398 aa  352  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  42.64 
 
 
398 aa  352  7e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.92172e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  42.54 
 
 
399 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  41.75 
 
 
393 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  43.14 
 
 
399 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  44.08 
 
 
394 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  44.25 
 
 
399 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  41.4 
 
 
398 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  42.39 
 
 
402 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  41.4 
 
 
398 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
399 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  45.06 
 
 
395 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  41.65 
 
 
397 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  44.25 
 
 
399 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  41.19 
 
 
397 aa  342  6e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3509  aromatic amino acid aminotransferase  43.91 
 
 
389 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  41.19 
 
 
397 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  41.15 
 
 
401 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>