More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1207 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  100 
 
 		 556 aa  1125    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  39.31 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  39.35 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  37.88 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  37.94 
 
 		 557 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.78 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  37.77 
 
 		 558 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.92 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  37.43 
 
 		 558 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  35.52 
 
 		 563 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  37.32 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.1 
 
 		 559 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.76 
 
 		 573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.9 
 
 		 561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.74 
 
 		 561 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.54 
 
 		 559 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  33.64 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  33.09 
 
 		 560 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.53 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.88 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  33.27 
 
 		 565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  32.6 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  38.24 
 
 		 557 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  36.35 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.37 
 
 		 559 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  38.76 
 
 		 544 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  32.25 
 
 		 581 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  35.76 
 
 		 557 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.01 
 
 		 557 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.99 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  31.76 
 
 		 599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.22 
 
 		 549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  33.99 
 
 		 560 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  35.52 
 
 		 559 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  32.06 
 
 		 552 aa  319  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.05 
 
 		 551 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.64 
 
 		 584 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 582 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  32.85 
 
 		 564 aa  310  5.9999999999999995e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  32.4 
 
 		 591 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  34.48 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  33.33 
 
 		 559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.85 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  34.27 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.67 
 
 		 568 aa  306  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  34.12 
 
 		 537 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.09 
 
 		 559 aa  306  8.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.26 
 
 		 559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  35.71 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  35.71 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  33.85 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  31.73 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.03 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  34.07 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  35.14 
 
 		 560 aa  297  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  35.32 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.43 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  29.91 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  32.66 
 
 		 549 aa  282  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  30.05 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.12 
 
 		 582 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  31.6 
 
 		 549 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  32.08 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  32.09 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.58 
 
 		 578 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  31.42 
 
 		 549 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  33.61 
 
 		 550 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.22 
 
 		 563 aa  273  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  31.68 
 
 		 585 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.78 
 
 		 547 aa  273  9e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  32.89 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  32.79 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.8 
 
 		 561 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.8 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.36 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.27 
 
 		 547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  32.34 
 
 		 544 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  35.65 
 
 		 555 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.71 
 
 		 561 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  30.6 
 
 		 571 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  31.67 
 
 		 545 aa  263  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  31.33 
 
 		 544 aa  263  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  29.92 
 
 		 550 aa  263  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.33 
 
 		 555 aa  260  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.55 
 
 		 547 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  33.95 
 
 		 652 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  33.33 
 
 		 555 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  31.76 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.25 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.16 
 
 		 549 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  34.2 
 
 		 555 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  29.72 
 
 		 556 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  31.86 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  31.46 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  31.46 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  29.6 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  29.6 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.43 
 
 		 551 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  31.6 
 
 		 560 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  33.62 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>