35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5202 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  67.42 
 
 		 90 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3042  hypothetical protein  56.98 
 
 		 97 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.152852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  60.71 
 
 		 224 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2539  hypothetical protein  60.98 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  42.53 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  38.64 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  40.48 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  41.98 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  41.98 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  32.95 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  32.95 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  32.95 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  36.47 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  36.47 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  36.47 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  36.47 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  30.59 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  35.42 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  28.24 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  30.68 
 
 		 286 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  29.89 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  27.06 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  32.94 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  32.94 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  32.94 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  32.94 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  32.94 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  33.7 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  31.17 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  31.03 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  29.89 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>