249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4785 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  46.67 
 
 
145 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  52.54 
 
 
310 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  50.86 
 
 
120 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  49.6 
 
 
337 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  51.24 
 
 
126 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  46.4 
 
 
147 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  49.59 
 
 
128 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  49.15 
 
 
126 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  48.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  47.46 
 
 
130 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  46.67 
 
 
135 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  47.41 
 
 
120 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  49.15 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  49.56 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  49.56 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  47.06 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.37 
 
 
841 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  47.37 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  47.46 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  46.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  41.53 
 
 
122 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44.36 
 
 
333 aa  94  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44.54 
 
 
1211 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  46.61 
 
 
127 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  46.03 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  45.76 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  43.09 
 
 
470 aa  90.1  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  44.54 
 
 
119 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  37.9 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5369  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  35.83 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  46.49 
 
 
295 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  43.22 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  37.07 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  42.5 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  36.75 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1419  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
123 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  36.67 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  42.37 
 
 
525 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  39.68 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  40.34 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  46.61 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  31.67 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  34.75 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  44.53 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.18 
 
 
612 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  34.71 
 
 
292 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  39.67 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  42.02 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  36.07 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  36.97 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  36.13 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  38.1 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  37.82 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  35.29 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  37.86 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  37.86 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1159  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000272925  normal  0.0363413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  35.65 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  35.19 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.81 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  31.36 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  31.62 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.48 
 
 
273 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.48 
 
 
273 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0517  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
291 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>