80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3548 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  100 
 
 
220 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  50.45 
 
 
224 aa  197  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  48.61 
 
 
238 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  42.42 
 
 
231 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  42.99 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  42.21 
 
 
239 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  41.06 
 
 
220 aa  154  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  47.13 
 
 
232 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  43.65 
 
 
240 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  43.43 
 
 
241 aa  152  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  45.15 
 
 
225 aa  148  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  46.15 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  44.68 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  46.51 
 
 
237 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  43.65 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  41.18 
 
 
242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  43.33 
 
 
237 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
235 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  43.33 
 
 
237 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  42.7 
 
 
240 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  43.55 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  43.09 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  40.88 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  41.26 
 
 
237 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  43.65 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  43.09 
 
 
238 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  40.66 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  44.44 
 
 
239 aa  138  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  42.54 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  40.28 
 
 
238 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  41.44 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  43.65 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  43.3 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  42.44 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  42.44 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  32.66 
 
 
234 aa  124  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  40 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  37.31 
 
 
218 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  36.08 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  34.39 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  34.39 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  33.5 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  31.05 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  30 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  34.43 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  34.43 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  36.61 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  30.32 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  32.28 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  30.05 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  37.78 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  32.76 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  34.52 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  31.34 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  37.22 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  31.44 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  31.32 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  30.35 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  28.27 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  26.85 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  30.39 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  33.15 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.16 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  30.94 
 
 
258 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  32.6 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  27.07 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  25.28 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2571  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0534  phosphoesterase, putative  23.89 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.988231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  28.41 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0926  phosphoesterase, putative  33.33 
 
 
260 aa  48.5  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1734  phosphoesterase, putative  25.13 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15714  normal  0.938972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>