92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1102 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  96.76 
 
 
216 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  85.19 
 
 
216 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  73.93 
 
 
219 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  59.91 
 
 
218 aa  257  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  57.08 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  58.6 
 
 
218 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  55.66 
 
 
227 aa  240  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  60.87 
 
 
226 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  55.4 
 
 
258 aa  232  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  53.17 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  49.31 
 
 
231 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  50.76 
 
 
227 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  50.47 
 
 
224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  50.47 
 
 
224 aa  197  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  52.63 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  45.59 
 
 
241 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  47.06 
 
 
238 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  45.71 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  45.08 
 
 
222 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  45.93 
 
 
220 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  35.89 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  42.29 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.39 
 
 
214 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  35.03 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  32.24 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  32.39 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  30.16 
 
 
214 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
238 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  31.55 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  29.95 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  30.48 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  34.33 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  38.28 
 
 
237 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  33.02 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  34.34 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  32.43 
 
 
238 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  35.42 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  35 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  31.08 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  32.06 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  30.77 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  31.5 
 
 
235 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  32.71 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  33.33 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  32.65 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  30.63 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  34.43 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  31.28 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  34.38 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  29.27 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  33.82 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  30.53 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  32.56 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  30.15 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  30.09 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  32.42 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  31.42 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  30.81 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0464  metallophosphoesterase  25.94 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0118793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  32.84 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  30.5 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1526  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.0019874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0443  metallophosphoesterase  25.76 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0393  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  31.22 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  30.35 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  28.28 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114454 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1928  phosphoesterase  26.67 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  27.46 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1734  phosphoesterase, putative  26.56 
 
 
249 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15714  normal  0.938972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2796  metallophosphoesterase  26.04 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0926  phosphoesterase, putative  27.32 
 
 
260 aa  52.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
235 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0316  phosphoesterase  20.33 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1509  phosphoesterase, putative  30.15 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0181928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0546  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
251 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2571  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1084  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0415  phosphoesterase  21.78 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0625  metallophosphoesterase  35.56 
 
 
272 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.53249  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
493 aa  41.6  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>