93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4310 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4310  ICC-like putative phosphoesterase  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1102  hypothetical protein  85.19 
 
 		 216 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1142  ICC-like protein putative phosphoesterase  85.65 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.221625  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1131  metallophosphoesterase  74.41 
 
 		 219 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1204  metallophosphoesterase  57.28 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  58.96 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  57.67 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2193  ICC-like putative phosphoesterase  61.54 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0751085  hitchhiker  0.00311079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4856  metallophosphoesterase  56.6 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0377  metallophosphoesterase  54.67 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3046  metallophosphoesterase  54.15 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0160441  normal  0.430681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1852  hypothetical protein  50.23 
 
 		 231 aa  207  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0308  metallophosphoesterase  51.89 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0944102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0313  metallophosphoesterase  51.42 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3549  ICC-like putative phosphoesterase  47.98 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1516  hypothetical protein  53.2 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0355  metallophosphoesterase  50.25 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1339  metallophosphoesterase  48.48 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6752  metallophosphoesterase  43.06 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4459  metallophosphoesterase  47.37 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0777  putative phosphoesterase  48.15 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01734  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.03 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2564  ICC-like putative phosphoesterase  36.36 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2962  metallophosphoesterase  40.67 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000570828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6865  metallophosphoesterase  35.61 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.999179  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3331  metallophosphoesterase  32.26 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3526  ICC-like phosphoesterase  34.18 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1757  metallophosphoesterase  30.96 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02260  hypothetical protein  32.18 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3548  ICC-like protein putative phosphoesterase  36.08 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08611  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.57 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.550698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2051  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.706568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0454  putative ICC-like phosphoesterase  35.94 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3028  metallophosphoesterase  33.85 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2312  metallophosphoesterase  37.44 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.198359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0659  putative metallo-phosphoesterase  37.44 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1614  ICC-like protein putative phosphoesterase  36.18 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4041  hypothetical protein  33.49 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0767  hypothetical protein  35.79 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.931754  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0825  hypothetical protein  32.55 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0000998399  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0573  ICC-like putative phosphoesterase  36.73 
 
 		 251 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0774  hypothetical protein  32.08 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00671  metallophosphoesterase  31.12 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0597826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0803  hypothetical protein  31.73 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  27.81 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.815111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0731  serine/threonine specific protein phosphatase  27.51 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.148819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0531  metallophosphoesterase  33.49 
 
 		 235 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0798  metallophosphoesterase  33.51 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235454  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07811  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.46 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1453  hypothetical protein  36.5 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0437211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1118  hypothetical protein  30.96 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0264  hypothetical protein  33.69 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0409149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0186  metallophosphoesterase  32.82 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0998122  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4612  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0538  metallophosphoesterase  31.56 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0616  hypothetical protein  31.09 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0746  hypothetical protein  31.75 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.895245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4250  putative ICC-like phosphoesterase  32.14 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887431  normal  0.946064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3155  putative ICC-like phosphoesterase  30.94 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3479  putative ICC-like phosphoesterase  31.11 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4759  putative ICC-like phosphoesterase  30.28 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3146  metallophosphoesterase  31.86 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0259204  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0985  hypothetical protein  31.63 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.280922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0876  metallophosphoesterase  30.89 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0233  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2537  ICC-like phosphoesterases-like  30.65 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0241  metallophosphoesterase  30.05 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0028  metallophosphoesterase  31.43 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3351  putative ICC-like phosphoesterase  30.49 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0414  putative metallo-phosphoesterase  33.33 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0152  metallophosphoesterase  30.21 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0373  hypothetical protein  33.51 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0203  putative phosphoesterase protein  30 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0464  metallophosphoesterase  21.96 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0118793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1928  phosphoesterase  24.75 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0393  metallophosphoesterase  23.53 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2823  hypothetical protein  28.8 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1526  metallophosphoesterase  24.32 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.0019874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2571  metallophosphoesterase  27.59 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0443  metallophosphoesterase  28.28 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2796  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1734  phosphoesterase, putative  24.87 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15714  normal  0.938972 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1310  metallophosphoesterase  29.02 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0926  phosphoesterase, putative  28 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0546  metallophosphoesterase  27.1 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0316  phosphoesterase  21.93 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0415  phosphoesterase  23.19 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1509  phosphoesterase, putative  31.22 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0181928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1084  metallophosphoesterase  22.04 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5194  metallophosphoesterase  33 
 
 		 293 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0625  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 272 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.53249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3084  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 319 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>