32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2029 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  37.01 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  31.75 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  30.37 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  34.15 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  31.51 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.92 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  29.73 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  29.08 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  28.87 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  27.86 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  24.64 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  26.35 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  31.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  43.55 
 
 		 451 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  30.07 
 
 		 130 aa  44.3  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  28.08 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  27.46 
 
 		 146 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  34.65 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  30.86 
 
 		 166 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  28.47 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.91 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>