37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0968 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0963  hypothetical protein  35.53 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0759041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  38.41 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  35.25 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  31.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  31.93 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  31.93 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  31.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  36.45 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  25.55 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  31.5 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  31.06 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  31.11 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  31.54 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.08 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  31.5 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  28.12 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  29 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3810  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.258605 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  25.19 
 
 		 138 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  46.03 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  28.03 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  34.65 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  30.46 
 
 		 182 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  32.54 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  30.34 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  30.22 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  35.71 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  30.53 
 
 		 136 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>