179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0038 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
203 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.73 
 
 
256 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.5 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.79 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.8 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  38.07 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.07 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.46 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1755  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.82 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.88 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.57 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.8 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0197  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.28 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  30.1 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.73 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.14 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.58 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.35 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.78 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.78 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.67 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.79 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.53 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.14 
 
 
252 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.57 
 
 
320 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.32 
 
 
252 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
255 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35 
 
 
238 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  35.44 
 
 
253 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  30.17 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  30.17 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1245  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.89 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.2 
 
 
360 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.2 
 
 
230 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.16 
 
 
241 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.19 
 
 
218 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.81 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.81 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.81 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0713  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.22 
 
 
254 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.065408  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  27.93 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.82 
 
 
251 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.11 
 
 
199 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
293 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3969  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.04 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0025103  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1439  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.72 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437325  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.33 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  38.2 
 
 
243 aa  52  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.56 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.72 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  34.58 
 
 
437 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  35.51 
 
 
437 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1827  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.91 
 
 
282 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.31058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4399  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.91 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.51 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  40.34 
 
 
502 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4970  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1164  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.26 
 
 
289 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0831  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.35 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1353  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.55 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  36.59 
 
 
255 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.79 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1402  PAP2 family protein  31.67 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.51 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
271 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  28.89 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0799  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.56 
 
 
313 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.54 
 
 
232 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  36.59 
 
 
255 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.72 
 
 
257 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0468  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9009  hypothetical protein  31.76 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4859  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.65 
 
 
302 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  41.3 
 
 
358 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  25.86 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.82 
 
 
521 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.52 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  37.76 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.58 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  35.45 
 
 
439 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.55 
 
 
438 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.51 
 
 
280 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  41.25 
 
 
248 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  46.84 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  25.3 
 
 
212 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  46.84 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.96 
 
 
201 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  33.81 
 
 
269 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2592  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39 
 
 
371 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  31.36 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.89 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  31.76 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1502  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.37 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00788847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>