36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  37.39 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  36.64 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  35.74 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  38.7 
 
 		 295 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  34.78 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  38.01 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  35.87 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  35.86 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  34.91 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  33.33 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  34.31 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  33.33 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  33.33 
 
 		 289 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  33.33 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  33.19 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  33.19 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  39.09 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  35.16 
 
 		 327 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  35.19 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  29.32 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  22.02 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  25.53 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  34.44 
 
 		 136 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  48.84 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5054  nucleotidyltransferase domain protein  42.86 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4819  nucleotidyltransferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4657  nucleotidyltransferase  42.86 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5184  nucleotidyltransferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4676  nucleotidyltransferase  40.82 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>