26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  813    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  29.73 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  29.77 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  27.83 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  31.01 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  28.46 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  30.37 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  31.65 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  28.84 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  28.39 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  29.88 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  28.02 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  26.11 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  29.43 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  29.3 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  25.3 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  29.62 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  30.08 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  26.08 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  36.49 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  27.4 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  28.03 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  28.38 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  26.52 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  30.92 
 
 		 145 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  28.18 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>