32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1335 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  28.8 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.12 
 
 
147 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  31.43 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  31.3 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  27.94 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  26.92 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  28.68 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  23.33 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  24.51 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  31.36 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  32.84 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  30.26 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  31.36 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  31.36 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  27.56 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  30.97 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  25.98 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  28.8 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.53 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  30.88 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  19.38 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.84 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  29.31 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.28 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  27.34 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>