49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2737 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2737  Trp operon repressor  100 
 
 
91 aa  187  3e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.12745e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3419  trp operon repressor  85.71 
 
 
91 aa  162  1e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1135  Trp operon repressor  85.56 
 
 
91 aa  160  4e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.74538e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1136  Trp operon repressor  85.56 
 
 
91 aa  160  4e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.23957e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1206  Trp operon repressor  85.56 
 
 
91 aa  160  4e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000153675  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1301  Trp operon repressor  82.42 
 
 
91 aa  160  5e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.84833e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1268  Trp operon repressor  82.42 
 
 
91 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.33975e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1224  Trp operon repressor  81.32 
 
 
91 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.36022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3089  Trp operon repressor  81.32 
 
 
91 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.54665e-07  hitchhiker  0.00665202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1076  Trp operon repressor  70 
 
 
117 aa  128  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  8.88346e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2909  Trp operon repressor  67.78 
 
 
92 aa  126  1e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0902  putative Trp operon repressor  68.89 
 
 
98 aa  126  1e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.478424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2743  Trp repressor  68.89 
 
 
91 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1267  Trp operon repressor  71.11 
 
 
92 aa  115  1e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.885699  hitchhiker  0.00351193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1172  Trp operon repressor  68.89 
 
 
92 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1063  Trp operon repressor  62.22 
 
 
91 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.844988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00999  Trp operon repressor  39.08 
 
 
100 aa  63.9  6e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004400  Trp operon repressor-like protein  37.93 
 
 
102 aa  63.9  7e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0676  Trp operon repressor  52.63 
 
 
109 aa  63.2  1e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107752  normal  0.490993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0231  Trp operon repressor  38.64 
 
 
118 aa  62.4  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0554  Trp operon repressor  43.42 
 
 
124 aa  59.3  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0659  Trp operon repressor  37.8 
 
 
108 aa  56.2  1e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3676  Trp operon repressor  49.02 
 
 
115 aa  55.8  2e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3870  Trp operon repressor  49.02 
 
 
115 aa  55.8  2e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0565  Trp operon repressor  49.06 
 
 
110 aa  54.3  6e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3482  Trp operon repressor  42.31 
 
 
130 aa  52.4  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0815  Trp operon repressor  42.31 
 
 
130 aa  52.4  2e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3612  Trp operon repressor  42.31 
 
 
130 aa  52.4  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4941  Trp operon repressor  48.15 
 
 
108 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4834  Trp operon repressor  48.15 
 
 
108 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4907  Trp operon repressor  48.15 
 
 
108 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4995  Trp operon repressor  48.15 
 
 
108 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4993  Trp operon repressor  48.15 
 
 
108 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.873782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0526  Trp operon repressor  47.92 
 
 
110 aa  51.2  5e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3604  Trp operon repressor  42.62 
 
 
98 aa  50.8  7e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04234  hypothetical protein  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4629  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4992  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04269  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5908  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.993559  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3663  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4945  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4941  Trp operon repressor  42.62 
 
 
108 aa  50.4  8e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1090  Trp operon repressor  46 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00338192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0621  Trp operon repressor  43.55 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1566  Trp operon repressor  39.06 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1666  Trp operon repressor  35.82 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0924  Trp operon repressor  27.4 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0659  Trp operon repressor  42.59 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>