More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0436 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  74.94 
 
 
431 aa  673  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0577  adenylosuccinate synthetase  76.98 
 
 
432 aa  700  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
432 aa  880  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  4.72279e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  76.8 
 
 
431 aa  691  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  76.51 
 
 
431 aa  686  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.97035e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  76.1 
 
 
431 aa  684  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  92.36 
 
 
432 aa  820  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 
430 aa  638  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  92.36 
 
 
432 aa  820  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 
430 aa  635  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  76.05 
 
 
431 aa  679  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.17238e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  75.81 
 
 
431 aa  679  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.82785e-07  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  73.97 
 
 
438 aa  672  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  92.13 
 
 
432 aa  820  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  70.71 
 
 
437 aa  655  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  1.95768e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  77.26 
 
 
431 aa  694  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  4.89804e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  76.33 
 
 
431 aa  685  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.09559e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  88.19 
 
 
432 aa  790  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  76.57 
 
 
431 aa  689  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.03533e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  76.51 
 
 
431 aa  687  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  77.03 
 
 
431 aa  691  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  77.03 
 
 
431 aa  691  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.10825e-05  hitchhiker  1.53755e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 
431 aa  636  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  74.88 
 
 
432 aa  687  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  74.77 
 
 
432 aa  682  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 
430 aa  638  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  76.1 
 
 
431 aa  683  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  74.48 
 
 
432 aa  670  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  88.66 
 
 
432 aa  801  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  75.69 
 
 
432 aa  678  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  90.28 
 
 
432 aa  806  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  76.1 
 
 
431 aa  682  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  4.71969e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  87.96 
 
 
432 aa  791  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  77.26 
 
 
431 aa  692  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  76.51 
 
 
431 aa  684  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.76094e-06  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  74.83 
 
 
438 aa  680  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  72.33 
 
 
431 aa  649  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  90.28 
 
 
432 aa  808  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  88.89 
 
 
432 aa  803  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  74.66 
 
 
438 aa  679  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  86.57 
 
 
432 aa  782  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 
430 aa  638  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  88.66 
 
 
432 aa  801  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  70 
 
 
430 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  70.23 
 
 
430 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  69.53 
 
 
430 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 
430 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  69.53 
 
 
431 aa  620  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  68.84 
 
 
430 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  67.67 
 
 
431 aa  612  1e-174  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  67.98 
 
 
430 aa  613  1e-174  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  67.05 
 
 
431 aa  605  1e-172  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  67.21 
 
 
429 aa  605  1e-172  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 
431 aa  607  1e-172  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  67.21 
 
 
432 aa  605  1e-172  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  64.58 
 
 
429 aa  578  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  65.28 
 
 
429 aa  578  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  63.66 
 
 
432 aa  574  1e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  63.72 
 
 
431 aa  574  1e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  64.19 
 
 
437 aa  572  1e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  7.37689e-12 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  63.89 
 
 
429 aa  572  1e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  63.19 
 
 
432 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  63.49 
 
 
431 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  63.72 
 
 
431 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  62.53 
 
 
435 aa  563  1e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  61.64 
 
 
446 aa  554  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  61.63 
 
 
431 aa  549  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  63.66 
 
 
431 aa  549  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  61.33 
 
 
446 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  60.7 
 
 
430 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  60.87 
 
 
448 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  61.1 
 
 
448 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  61.1 
 
 
448 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  59.81 
 
 
435 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  61.33 
 
 
448 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  2.99679e-06 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  61.1 
 
 
448 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  59.3 
 
 
430 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  59.77 
 
 
430 aa  529  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  60.87 
 
 
448 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  60.64 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  60.87 
 
 
448 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  60.87 
 
 
448 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  61.56 
 
 
448 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  8.7591e-07 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  59.35 
 
 
435 aa  531  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  60.68 
 
 
446 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  61.33 
 
 
448 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  59.07 
 
 
430 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  61.1 
 
 
448 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  60.87 
 
 
446 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>