62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6095 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
303 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.88 
 
 
264 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6096  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  62.39 
 
 
254 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.97 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
142 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  33.06 
 
 
143 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  31.75 
 
 
521 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2030  hypothetical protein  32.52 
 
 
481 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.533222  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2947  hypothetical protein  32.52 
 
 
481 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0687281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3232  hypothetical protein  34.15 
 
 
481 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2927  hypothetical protein  34.13 
 
 
482 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3238  hypothetical protein  34.15 
 
 
481 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2989  hypothetical protein  34.15 
 
 
482 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3224  hypothetical protein  32.52 
 
 
498 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3002  hypothetical protein  34.15 
 
 
482 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0878761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.5 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3259  hypothetical protein  32.54 
 
 
481 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3256  hypothetical protein  33.33 
 
 
481 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.218487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
190 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.59 
 
 
475 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  34.75 
 
 
408 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.28 
 
 
250 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1698  hypothetical protein  30.08 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41368e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.65 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
398 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.06 
 
 
370 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.72 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 
397 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 
368 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  31.36 
 
 
411 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.3 
 
 
247 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  28.86 
 
 
568 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  34.48 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.59 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0270028  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.65 
 
 
212 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  30.63 
 
 
418 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.73 
 
 
210 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.76 
 
 
230 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 
470 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  28.81 
 
 
419 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  27.27 
 
 
574 aa  46.2  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 
257 aa  46.2  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.51 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  30.43 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.93 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.19 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
214 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4125  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  29.57 
 
 
354 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 
498 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  31.53 
 
 
349 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1378  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.95 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.2 
 
 
396 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
628 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30 
 
 
139 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.29 
 
 
142 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  30.77 
 
 
493 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  27.12 
 
 
507 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>