16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5398 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  48.61 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  52.86 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  47.44 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  32 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  31.43 
 
 		 85 aa  43.9  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  35.29 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  43.48 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  39.62 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  39.62 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  39.62 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  37.68 
 
 		 83 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  33.82 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>