More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4334 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
645 aa  1317  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.84 
 
 
646 aa  976  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.25 
 
 
664 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2789  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  52.31 
 
 
670 aa  614  1e-174  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.16 
 
 
678 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.16 
 
 
678 aa  608  1e-172  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.49 
 
 
666 aa  605  1e-172  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.5 
 
 
655 aa  601  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.85 
 
 
676 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.465909  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  47.28 
 
 
666 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  45.93 
 
 
678 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  45.15 
 
 
660 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  45.1 
 
 
660 aa  540  1e-152  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.34 
 
 
657 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  39.62 
 
 
658 aa  446  1e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.6 
 
 
627 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.44 
 
 
624 aa  358  1e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.04 
 
 
621 aa  355  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0777  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.98 
 
 
670 aa  349  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.159884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.53 
 
 
634 aa  348  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.03 
 
 
625 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7772  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.11 
 
 
654 aa  346  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  34.89 
 
 
643 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3705  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.49 
 
 
647 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.87 
 
 
641 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.71 
 
 
643 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.19 
 
 
628 aa  329  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.7 
 
 
639 aa  329  1e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.33 
 
 
631 aa  328  2e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.72 
 
 
625 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.29 
 
 
629 aa  327  4e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.09 
 
 
646 aa  327  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0185  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.49 
 
 
670 aa  327  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.42 
 
 
633 aa  327  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0032  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.85 
 
 
672 aa  326  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.579611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.53 
 
 
637 aa  324  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.32 
 
 
641 aa  323  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.71 
 
 
629 aa  321  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.07 
 
 
635 aa  320  4e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.35 
 
 
632 aa  319  9e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  34.84 
 
 
642 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.56 
 
 
634 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.06 
 
 
629 aa  313  5e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.28 
 
 
631 aa  313  7e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2633  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.73 
 
 
674 aa  309  8e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.718376 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2260  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.68 
 
 
674 aa  309  1e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.6 
 
 
619 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.54 
 
 
592 aa  305  1e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.74 
 
 
647 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.72 
 
 
626 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3554  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.82 
 
 
640 aa  300  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.26 
 
 
632 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.88023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.36 
 
 
635 aa  297  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.72 
 
 
638 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 
619 aa  293  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.68 
 
 
633 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.26358e-07  unclonable  6.28543e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.00713e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.74005e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.49 
 
 
629 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.60892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  7.47097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.68 
 
 
633 aa  292  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.11 
 
 
603 aa  290  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.85 
 
 
633 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.33092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.46 
 
 
635 aa  290  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.18 
 
 
655 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.59 
 
 
633 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.97095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.02 
 
 
655 aa  286  1e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  32.13 
 
 
632 aa  285  2e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1617  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.85 
 
 
583 aa  283  5e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  32.13 
 
 
632 aa  283  9e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.26 
 
 
622 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.81 
 
 
605 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.28708e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.82 
 
 
622 aa  282  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  29.99 
 
 
630 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.83 
 
 
629 aa  281  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1597  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.42 
 
 
640 aa  280  4e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.09 
 
 
627 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.9 
 
 
607 aa  280  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.5 
 
 
602 aa  279  9e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.98 
 
 
591 aa  279  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.2 
 
 
606 aa  279  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.22 
 
 
632 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.02 
 
 
658 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  32.1 
 
 
569 aa  277  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.13 
 
 
655 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.39 
 
 
591 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.68 
 
 
633 aa  276  1e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.5 
 
 
662 aa  275  2e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.17 
 
 
613 aa  275  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.98 
 
 
655 aa  275  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.38 
 
 
656 aa  273  5e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.73 
 
 
589 aa  273  5e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.38 
 
 
656 aa  273  5e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.09 
 
 
615 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.38 
 
 
656 aa  273  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.19 
 
 
607 aa  273  9e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  30.18 
 
 
637 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>