More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1264 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1264  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00933319  normal  0.787413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1934  phosphopantetheine adenylyltransferase  84.57 
 
 
164 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1748  phosphopantetheine adenylyltransferase  85.19 
 
 
164 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2445  phosphopantetheine adenylyltransferase  76.07 
 
 
164 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1095  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.1 
 
 
164 aa  220  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.756098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1056  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.1 
 
 
164 aa  220  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2180  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.26 
 
 
164 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5193  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.64 
 
 
166 aa  204  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5029  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 
167 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0456512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4569  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 
167 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1402  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.26 
 
 
166 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.64 
 
 
167 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4459  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.75 
 
 
166 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0738  phosphopantetheine adenylyltransferase  62.28 
 
 
169 aa  197  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.49 
 
 
169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.12 
 
 
167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2588  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.59 
 
 
165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14268  normal  0.384811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.59 
 
 
165 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.33 
 
 
165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.96 
 
 
165 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3787  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  58.49 
 
 
169 aa  188  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.403122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.59 
 
 
164 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1799  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.23 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195414  normal  0.107346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2344  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.86 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3551  phosphopantetheine adenylyltransferase  60 
 
 
167 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.8 
 
 
162 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.84 
 
 
170 aa  147  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.64 
 
 
169 aa  147  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0105  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.21 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00317746  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.5 
 
 
158 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  45 
 
 
160 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1629  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.72 
 
 
165 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.435366  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.58 
 
 
172 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.62 
 
 
162 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
167 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
167 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1924  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
165 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
160 aa  141  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4112  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.017297  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.94 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4107  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1793  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.162855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0392  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0285  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30794  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0065  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.24 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000149443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4151  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.24 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000257789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0059  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.24 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000113354  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.94 
 
 
161 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.33 
 
 
159 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.94 
 
 
159 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
163 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03491  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4059  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000154368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4135  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.48 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.56 
 
 
159 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4033  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  45.4 
 
 
160 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.3 
 
 
164 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.3 
 
 
164 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.84 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2741  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.74 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.86 
 
 
168 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  38.51 
 
 
163 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.12 
 
 
163 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.07 
 
 
183 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.3 
 
 
164 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0326  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.55 
 
 
170 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.688108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0338  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.24 
 
 
161 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.660339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.04 
 
 
166 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3620  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.75 
 
 
162 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.870553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00659  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.75 
 
 
159 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.33 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.72 
 
 
159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.18 
 
 
169 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.99 
 
 
164 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.75 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.5 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  39.16 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3502  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.77 
 
 
166 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000195906 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.75 
 
 
168 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1550  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.5 
 
 
169 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0805117  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  39.75 
 
 
169 aa  135  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0390  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
168 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4471  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.14 
 
 
163 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1186  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.41 
 
 
170 aa  135  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>