70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2140 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1938  hypothetical protein  78.55 
 
 
393 aa  649  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.60978e-06  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2037  hypothetical protein  78.55 
 
 
399 aa  647  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.41693e-08  hitchhiker  0.000596189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2140  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  808  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.6162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2190  hypothetical protein  97.19 
 
 
392 aa  790  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.70817e-07  unclonable  5.74894e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1876  hypothetical protein  85.2 
 
 
392 aa  702  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.89639e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2140  hypothetical protein  78.55 
 
 
410 aa  649  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.44093e-07  hitchhiker  3.49236e-05 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4517  hypothetical protein  97.45 
 
 
392 aa  788  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2244  hypothetical protein  97.19 
 
 
392 aa  788  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.19779e-08  decreased coverage  4.94195e-11 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2231  hypothetical protein  97.45 
 
 
392 aa  788  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.96649e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2329  hypothetical protein  75.19 
 
 
395 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2338  hypothetical protein  76.3 
 
 
392 aa  611  1e-174  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.22197e-06  hitchhiker  0.000102479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1909  hypothetical protein  73.08 
 
 
395 aa  604  1e-172  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00034683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2269  hypothetical protein  67.6 
 
 
392 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000211648  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1991  hypothetical protein  68.45 
 
 
407 aa  561  1e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.90048e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1700  hypothetical protein  65.9 
 
 
388 aa  542  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.44386e-06  normal  0.0296487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2050  hypothetical protein  64.74 
 
 
404 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000198084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1916  hypothetical protein  65.05 
 
 
389 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.31696e-06  unclonable  2.1691e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1764  hypothetical protein  45.6 
 
 
378 aa  327  2e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.862195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3629  hypothetical protein  45.62 
 
 
378 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1432  hypothetical protein  45.24 
 
 
377 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62375  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2129  hypothetical protein  45.57 
 
 
380 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325483  normal  0.257058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27200  hypothetical protein  43.64 
 
 
376 aa  313  4e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0597023  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3857  hypothetical protein  45.24 
 
 
377 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1857  hypothetical protein  44.99 
 
 
377 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1467  hypothetical protein  44.22 
 
 
377 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15270  hypothetical protein  45.19 
 
 
377 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2303  hypothetical protein  42.34 
 
 
376 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000136711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4000  hypothetical protein  43.78 
 
 
380 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000276231  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0133  hypothetical protein  41.06 
 
 
395 aa  283  3e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1000  hypothetical protein  41.06 
 
 
397 aa  283  5e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320089  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0935  hypothetical protein  40.05 
 
 
397 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224232  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2245  hypothetical protein  41.16 
 
 
387 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1094  hypothetical protein  41.45 
 
 
397 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1018  hypothetical protein  40.1 
 
 
397 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2890  hypothetical protein  39.49 
 
 
397 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780148  normal  0.230135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2411  hypothetical protein  40.98 
 
 
383 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1070  hypothetical protein  39.5 
 
 
396 aa  269  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000120552  normal  0.185672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2036  hypothetical protein  40.42 
 
 
360 aa  267  3e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406778  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2162  hypothetical protein  38.83 
 
 
397 aa  266  6e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0856  hypothetical protein  36.62 
 
 
381 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1754  hypothetical protein  40.1 
 
 
366 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1022  hypothetical protein  38.73 
 
 
395 aa  255  1e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0850  hypothetical protein  42.38 
 
 
393 aa  254  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0187674  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4254  hypothetical protein  39.75 
 
 
397 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1100  hypothetical protein  38.9 
 
 
397 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0662  hypothetical protein  38.9 
 
 
397 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1142  hypothetical protein  38.9 
 
 
397 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0566  hypothetical protein  40.32 
 
 
382 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1738  hypothetical protein  37.88 
 
 
406 aa  245  1e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1897  hypothetical protein  37.22 
 
 
410 aa  245  1e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2831  hypothetical protein  42.36 
 
 
406 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2823  hypothetical protein  42.36 
 
 
406 aa  235  1e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0821891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1781  hypothetical protein  42.36 
 
 
406 aa  235  1e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2885  hypothetical protein  42.99 
 
 
431 aa  235  1e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2770  hypothetical protein  42.04 
 
 
402 aa  234  2e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0551  hypothetical protein  42.68 
 
 
434 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2458  hypothetical protein  42.68 
 
 
406 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2874  hypothetical protein  40.3 
 
 
370 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407828  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2361  hypothetical protein  40.3 
 
 
370 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1961  hypothetical protein  37.2 
 
 
356 aa  221  1e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2872  hypothetical protein  40.13 
 
 
377 aa  215  1e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0270524  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3073  hypothetical protein  36.61 
 
 
375 aa  213  4e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1933  hypothetical protein  38.74 
 
 
405 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2243  hypothetical protein  39.3 
 
 
381 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1649  hypothetical protein  37.99 
 
 
362 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1626  hypothetical protein  35.5 
 
 
375 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1780  hypothetical protein  36.64 
 
 
387 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0422  hypothetical protein  35.73 
 
 
356 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0414  hypothetical protein  37.28 
 
 
356 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0586317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2702  hypothetical protein  37.88 
 
 
426 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.425385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>