More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0848 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0848  glutamate--tRNA ligase  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.66391e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0871  Glutamate--tRNA ligase  97.7 
 
 
304 aa  612  1e-174  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.93825e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0883  glutamate--tRNA ligase  97.37 
 
 
304 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.49981e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3491  glutamate--tRNA ligase  95.72 
 
 
304 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.45607e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3129  glutamate--tRNA ligase  82.55 
 
 
299 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  9.21619e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3293  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  78.95 
 
 
299 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.89418e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3405  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  78.62 
 
 
299 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.37292e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0729  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  78.62 
 
 
299 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.94668e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0873  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  77.15 
 
 
299 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0697  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  68.73 
 
 
292 aa  414  1e-115  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.8618e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3171  glutamate--tRNA ligase  70.24 
 
 
287 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  8.37027e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3799  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  67.89 
 
 
299 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.13424e-06  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0779  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  67.69 
 
 
290 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00289158  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3130  glutamate--tRNA ligase  65.89 
 
 
319 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.03356e-07  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3277  glutamate--tRNA ligase  66.55 
 
 
293 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  5.1469e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3900  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  64.75 
 
 
305 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.43108e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  55.44 
 
 
308 aa  313  3e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.30797e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00142  hypothetical protein  54.42 
 
 
308 aa  307  2e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  7.3692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3515  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.42 
 
 
308 aa  307  2e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000809743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00143  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.42 
 
 
308 aa  307  2e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  9.65107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0148  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.86 
 
 
308 aa  306  2e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.29858e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0147  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.86 
 
 
308 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.35998e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3458  Glutamate--tRNA ligase  54.86 
 
 
308 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.33336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0213  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.54 
 
 
313 aa  306  4e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0227861  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0202  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.54 
 
 
313 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0366994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0201  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.54 
 
 
313 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000353889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0217  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.54 
 
 
313 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0219  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.54 
 
 
313 aa  304  1e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  4.98005e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0126  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.33 
 
 
296 aa  303  2e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  3.6555e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.17 
 
 
308 aa  303  2e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.16792e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  54.01 
 
 
308 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.52983e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0684  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.33 
 
 
296 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000131697  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3115  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  52.82 
 
 
352 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000632224  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2820  Glutamate--tRNA ligase  55.09 
 
 
302 aa  295  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00525716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1031  Glutamate--tRNA ligase  52.86 
 
 
302 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.011538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1163  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  53.04 
 
 
322 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4307  tRNA synthetase class I family protein  50.99 
 
 
315 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  51.86 
 
 
303 aa  292  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002564  glutamyl-Q-tRNA synthetase  51.9 
 
 
287 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.02231e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.68 
 
 
321 aa  286  3e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.26145e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.34 
 
 
394 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.16518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  51.34 
 
 
384 aa  284  1e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.29322e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0583  glutamate--tRNA ligase  50.85 
 
 
308 aa  282  5e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03546  putative glutamyl-tRNA synthetase-relatedprotein  42.68 
 
 
327 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00695044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  49.47 
 
 
283 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03447  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  49.45 
 
 
266 aa  254  2e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.69 
 
 
293 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5440  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.05 
 
 
293 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  48.99 
 
 
299 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.17 
 
 
298 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.84 
 
 
301 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  46.71 
 
 
294 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.19 
 
 
300 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.19 
 
 
300 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48174e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.33 
 
 
295 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  6.57167e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.75 
 
 
295 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87127e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  45.17 
 
 
295 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00405  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.86 
 
 
299 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0673  glutamate--tRNA ligase  45.42 
 
 
305 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  45.92 
 
 
318 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.29 
 
 
295 aa  233  4e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3373  glutamate--tRNA ligase  48.26 
 
 
298 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0303473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.63 
 
 
298 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  45.07 
 
 
295 aa  228  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  42.68 
 
 
311 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.78146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3936  glutamate--tRNA ligase  45.77 
 
 
305 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.30965e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  44.77 
 
 
314 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  41.08 
 
 
303 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.76322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  42.63 
 
 
338 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2749  Glutamate--tRNA ligase  45.96 
 
 
306 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242915  normal  0.441865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.76 
 
 
310 aa  219  4e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.08 
 
 
314 aa  219  4e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  42.11 
 
 
310 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3061  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  46.98 
 
 
291 aa  216  3e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.293014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  43.15 
 
 
311 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.49 
 
 
310 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
301 aa  216  6e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0518  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  40.21 
 
 
302 aa  213  2e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.67 
 
 
301 aa  212  6e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  41.89 
 
 
300 aa  211  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.66 
 
 
296 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.02 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0690  glutamate--tRNA ligase  44.18 
 
 
300 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.858834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  41.38 
 
 
312 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  43.89 
 
 
310 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.54 
 
 
294 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  41.14 
 
 
327 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  44.03 
 
 
302 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  42.95 
 
 
309 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.66 
 
 
298 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.27 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.27 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  45.24 
 
 
297 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  42.81 
 
 
292 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.87 
 
 
298 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.64 
 
 
294 aa  200  2e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  38.11 
 
 
313 aa  200  2e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.72 
 
 
297 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  44.72 
 
 
297 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.13 
 
 
315 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>