26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3443 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1130    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1130    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  37.84 
 
 		 548 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  32.39 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  30.75 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  34.55 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  29.54 
 
 		 579 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  24.16 
 
 		 552 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  24.59 
 
 		 633 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  23.55 
 
 		 633 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0267  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1470  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0264078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3329  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7314  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7405  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7707  hypothetical protein  22.26 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26795  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  25.84 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  22.02 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  21.68 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5719  hypothetical protein  25.46 
 
 		 323 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1898  hypothetical protein  23.29 
 
 		 896 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3464  hypothetical protein  23.29 
 
 		 896 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  22.59 
 
 		 595 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  22.59 
 
 		 595 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  22.59 
 
 		 595 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  20.72 
 
 		 599 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>