23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2693 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  45.9 
 
 		 187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  44.75 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  41.85 
 
 		 186 aa  158  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  38.59 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  33.53 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  30.85 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  32 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  31.49 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  30.77 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.14 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  28.14 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  30.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  23.4 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4280  hypothetical protein  33.67 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>