29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0603 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  100 
 
 
319 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  27.98 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  27.35 
 
 
240 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  26.83 
 
 
240 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  26.83 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  26.83 
 
 
240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  26.83 
 
 
240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  26.83 
 
 
240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  26.83 
 
 
240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  26.83 
 
 
240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  29.17 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  29.17 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  26 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  26.29 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  27.49 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  27.49 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  25.9 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  28.79 
 
 
384 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7157  lipase class 3  27.18 
 
 
291 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  28.4 
 
 
448 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  27.39 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  30.16 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  26.23 
 
 
891 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  29.44 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  28.57 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6230  lipase class 3  21.59 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  28.22 
 
 
539 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  30.06 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  28.57 
 
 
727 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>