More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0342 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  60.69 
 
 		 494 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  64.2 
 
 		 499 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  65.44 
 
 		 503 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  73.57 
 
 		 494 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  72.13 
 
 		 494 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  64.6 
 
 		 501 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  66.05 
 
 		 503 aa  688    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  65.78 
 
 		 504 aa  694    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  64.39 
 
 		 501 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  72.91 
 
 		 494 aa  754    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  65.38 
 
 		 502 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  64.37 
 
 		 502 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  65.38 
 
 		 502 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  67.21 
 
 		 505 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  64.54 
 
 		 500 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  72.75 
 
 		 493 aa  753    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  65.38 
 
 		 502 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  73.98 
 
 		 494 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  65.05 
 
 		 505 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  65.38 
 
 		 502 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  1027    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  63.92 
 
 		 499 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  73.98 
 
 		 494 aa  759    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  72.45 
 
 		 495 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  60.16 
 
 		 494 aa  641    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  72.24 
 
 		 495 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  61.43 
 
 		 500 aa  634    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  61.43 
 
 		 500 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  72.22 
 
 		 494 aa  751    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  71.72 
 
 		 494 aa  748    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  60.86 
 
 		 498 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  75.77 
 
 		 498 aa  782    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  63.37 
 
 		 501 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  65.03 
 
 		 505 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  65.66 
 
 		 507 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  71.69 
 
 		 494 aa  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  65.66 
 
 		 507 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  66.26 
 
 		 502 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  65.11 
 
 		 503 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  65.03 
 
 		 505 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  72.51 
 
 		 498 aa  764    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  71.08 
 
 		 495 aa  742    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  64.2 
 
 		 499 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  64.23 
 
 		 507 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  64.57 
 
 		 502 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  65.38 
 
 		 502 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  62.45 
 
 		 497 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  64.42 
 
 		 503 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  65.45 
 
 		 505 aa  690    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  63.45 
 
 		 505 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  73.77 
 
 		 494 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  65.66 
 
 		 507 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  60.08 
 
 		 501 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  59.39 
 
 		 496 aa  625  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  61.51 
 
 		 496 aa  624  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  59.8 
 
 		 496 aa  624  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  59.47 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  57.99 
 
 		 498 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  58.57 
 
 		 498 aa  612  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  57.99 
 
 		 498 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  56.77 
 
 		 507 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  61.63 
 
 		 501 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  57.41 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  57.38 
 
 		 496 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  57.38 
 
 		 496 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  57.29 
 
 		 496 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  60 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  57.38 
 
 		 496 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  57.38 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  57.38 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  57.38 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  56.97 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  58.11 
 
 		 499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  56.97 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  57.67 
 
 		 489 aa  599  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  58.32 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  59.06 
 
 		 505 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  56.35 
 
 		 496 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  58.11 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  56.88 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  56.88 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  56.88 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  58.5 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  56.15 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  56.3 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  56.67 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  55.76 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  57.49 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  56.88 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  59.02 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  56.82 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  56.67 
 
 		 499 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>