43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3789 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  48.79 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  49.76 
 
 		 214 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  44.26 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  43.72 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  43.72 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  34.43 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  27.6 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  29.31 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  28.57 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  32.11 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  31.13 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  27.72 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  31.13 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  31.13 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  32.54 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  33.94 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  31.95 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  31.95 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  30.2 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  30.33 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  29.25 
 
 		 224 aa  85.5  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  31.55 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  31.28 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  31.91 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  28 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  30.57 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  28 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  28 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  28 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  28 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  28 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  28 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  28 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  29.36 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  24.66 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  24.11 
 
 		 449 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>