26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1779 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  48.45 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  45.36 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  43.3 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  43.3 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  43.3 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  44.33 
 
 		 93 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  43.3 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  44.33 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  44.33 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  43.3 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  43.3 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  39.8 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  41.18 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  49.32 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  41.24 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1838  DsrH family protein  38 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000194131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3995  hypothetical protein  38 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00527203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3399  sulfur relay protein TusB/DsrH  37 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.439562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3170  DsrH like protein  33 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225205  normal  0.258355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3340  DsrH family protein  34 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3577  DsrH like protein  34.34 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2379  DsrH family protein  36.63 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764227  normal  0.0193551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002296  hypothetical protein  36 
 
 		 61 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000439536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28140  dissimilatory sulfite reductase, DsrH-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00058  hypothetical protein  29.17 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>