17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2133 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2133  DsrH family protein  100 
 
 		 71 aa  143  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0139279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2476  sulfur relay protein TusB/DsrH  54.93 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656489  hitchhiker  0.0000966631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2163  DsrH family protein  60.87 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000886637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2198  sulfur relay protein TusB/DsrH  60.87 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267344  normal  0.0843026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2316  DsrH family protein  60.87 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000019534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2208  DsrH family protein  60.87 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2004  DsrH family protein  59.42 
 
 		 93 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000377209  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2006  DsrH family protein  57.97 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.039715  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1970  DsrH family protein  57.97 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  0.848273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2057  DsrH family protein  57.97 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276019  hitchhiker  0.000313289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2378  hypothetical protein  57.97 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2017  DsrH like protein  50.7 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000931832  hitchhiker  0.000744283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2108  DsrH family protein  55.07 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1801  hypothetical protein  48.68 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1779  hypothetical protein  49.32 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.2752  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1806  DsrH like protein  43.42 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000305366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 101 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>