More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0268 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 78 aa  157  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0288  translation initiation factor IF-1  71.25 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  77.94 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  79.41 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  76.47 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  73.91 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  79.41 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  79.41 
 
 		 72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  76.47 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  76.47 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0421  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 74 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 73 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  73.53 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  73.91 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  73.91 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  79.41 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  70.13 
 
 		 73 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 73 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 73 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  71.01 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  69.12 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  69.12 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  78.12 
 
 		 72 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  72.06 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  73.44 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  73.53 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  64.94 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 73 aa  107  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  77.05 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  63.77 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  66.67 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  74.19 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  63.64 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  63.64 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  72.06 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  69.57 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  66.18 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  68.12 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  69.12 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  70.59 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  65.22 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  64.94 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  60 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  69.12 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>