162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2344 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  68.06 
 
 
194 aa  274  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  68.06 
 
 
194 aa  274  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  44.97 
 
 
211 aa  147  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  42.03 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  44.86 
 
 
192 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.33 
 
 
204 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.15 
 
 
212 aa  140  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.4 
 
 
199 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.78 
 
 
214 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  42.05 
 
 
207 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.86 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.36 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  43.01 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.41 
 
 
204 aa  131  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.49 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.61 
 
 
210 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  39.68 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.94 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.4 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.02 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  41.94 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.94 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  41.94 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.94 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.94 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.24 
 
 
204 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  41.94 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.93 
 
 
210 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.19 
 
 
206 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  39.8 
 
 
210 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.31 
 
 
210 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.12 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.68 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.23 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  37.97 
 
 
212 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  40.11 
 
 
271 aa  118  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  37.25 
 
 
212 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.02 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.77 
 
 
221 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.61 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.88 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.96 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  39.34 
 
 
211 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  39.34 
 
 
211 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  39.57 
 
 
210 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.19 
 
 
211 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.17 
 
 
220 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.64 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.59 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.68 
 
 
210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.11 
 
 
215 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.71 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  37.43 
 
 
216 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  36.72 
 
 
208 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.51 
 
 
205 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.46 
 
 
221 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.43 
 
 
252 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.04 
 
 
210 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.86 
 
 
215 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.86 
 
 
211 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.9 
 
 
216 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  34.55 
 
 
220 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.46 
 
 
213 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.83 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.43 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.8 
 
 
215 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.67 
 
 
215 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.65 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.16 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.66 
 
 
213 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  30.16 
 
 
567 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.92 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  34.2 
 
 
217 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.84 
 
 
207 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.85 
 
 
210 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.8 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.33 
 
 
215 aa  92.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.93 
 
 
218 aa  91.3  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.95 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.12 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.93 
 
 
224 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  30.93 
 
 
224 aa  88.2  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.93 
 
 
224 aa  88.2  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  30.26 
 
 
213 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.06 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  29.5 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  28.22 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  28.22 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  27.72 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  28.57 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  27.72 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  27.72 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  29.57 
 
 
544 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  30.05 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  32.37 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  32.37 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  32.37 
 
 
544 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  27.8 
 
 
612 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>