More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1809 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.19097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.60601e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.19555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.50239e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.31634e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.69266e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.23661e-11  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.8346e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.87625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.09815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.06677e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  132  1e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  83.33 
 
 
85 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  8e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  83.33 
 
 
72 aa  129  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.98783e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  81.69 
 
 
83 aa  127  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.20042e-14  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  127  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.71749e-08  hitchhiker  4.19913e-09 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  127  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  79.17 
 
 
72 aa  126  8e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  127  8e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
75 aa  125  1e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  126  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.77018e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  125  1e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  125  1e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.52368e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
73 aa  125  1e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  1.64388e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  76.39 
 
 
73 aa  125  2e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  125  2e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.23872e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  125  2e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  3.59666e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  125  2e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.27108e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  80.56 
 
 
72 aa  125  2e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  124  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  124  4e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.17845e-06  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  124  4e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 
73 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  78.87 
 
 
73 aa  124  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  3.41025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  123  8e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.04366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.35268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.56493e-07  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.28141e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.68658e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.96746e-08  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  75 
 
 
72 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.63825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  121  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  2.65509e-05  hitchhiker  1.4317e-05 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.47738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  2.87842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  73.97 
 
 
73 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  70.83 
 
 
87 aa  119  1e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  2e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  3.10182e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  2e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  2.52323e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.05996e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.18565e-13  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.18496e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  117  4e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  4e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  7.44837e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  5e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  78.26 
 
 
71 aa  117  5e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2691  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.60853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1981  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1713  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.846652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2366  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.302955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2266  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  72.6 
 
 
73 aa  117  8e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  8e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  71.23 
 
 
73 aa  117  8e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  117  8e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  72.6 
 
 
73 aa  115  1e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  68.06 
 
 
73 aa  116  1e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  1.38941e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  116  1e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  1e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  1.8307e-05  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
77 aa  116  1e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
73 aa  116  1e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.54065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 
73 aa  116  1e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.44265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>