45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1130 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  81.56 
 
 		 179 aa  310  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  81.56 
 
 		 179 aa  310  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  57 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  55.77 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  55.61 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  53.92 
 
 		 211 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  53.43 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  53.92 
 
 		 210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  53.92 
 
 		 210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  53.43 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  53.43 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  53.43 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  53.43 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  53.92 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  53.92 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  53.43 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  56.85 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  52.2 
 
 		 209 aa  228  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  51.2 
 
 		 213 aa  227  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  53.4 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  47.83 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  50.96 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.6 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  49.04 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  43.41 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  48.56 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.83 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  39.6 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.13 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  28.21 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.89 
 
 		 903 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2412  3H domain protein  35.59 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.063026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1531  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.92 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000666791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.08 
 
 		 903 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1772  CBS domain containing protein  22.56 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.59 
 
 		 333 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 253 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 263 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 256 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.95 
 
 		 155 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  31.87 
 
 		 300 aa  41.6  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.1 
 
 		 259 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>